ลุ่มน้ำเจ้าพระยาตอนบนประกอบด้วยแม่น้ำสายหลักทั้งหมด 4 สาย คือ แม่น้ำปิง วัง ยม น่าน ครอบคลุมพื้นที่ตั้งแต่ใต้เขื่อนภูมิพล กิ่วลม สิริกิติ์ตลอดแนวลงทางทิศใต้จนถึงบริเวณบึงบอระเพ็ด จังหวัดนครสวรรค์ การคำนวณปริมาณน้ำบริเวณลุ่มน้ำเจ้าพระยาตอนบนใช้ข้อมูลน้ำระบายจากเขื่อนภูมิพล สิริกิติ์ กิ่วลม แควน้อย และสถานีวัดน้ำท่า Y.1C สะพานบ้านน้ำโค้ง
ส่วนลุ่มน้ำเจ้าพระยาตอนกลางครอบคลุมตั้งแต่บริเวณบึงบอระเพ็ดจนถึงเขื่อนเจ้าพระยาจังหวัดชัยนาท ระหว่างทางมีการรับน้ำจากแม่น้ำสะแกกรังจังหวัดอุทัยธานี และผันน้ำออกสู่เส้นทางหลักสี่เส้นทางคือ คลองชัยนาท-ป่าสัก คลองมะขามเฒ่าอู่ทอง แม่น้ำท่าจีน และแม่น้ำน้อย การคำนวณปริมาณน้ำใช้ข้อมูลที่สถานีวัดน้ำท่า C.2 ค่ายจิรประวัติ และสถานี C.13 ท้ายเขื่อนเจ้าพระยา

โดยส่วนใหญ่ปริมาณน้ำไหลผ่านที่ท้ายเขื่อนเจ้าพระยาจะน้อยกว่าที่ค่ายจิรประวัติอันเนื่องมาจากมีการระบายน้ำออกทั้งทางด้านตะวันตกและตะวันออกของแม่น้ำ และเกิดการใช้น้ำจากภาคการเกษตรในบริเวณดังกล่าวค่อนข้างมาก ยกเว้นน้ำที่ไหลมาจากทางภาคเหนือและแม่น้ำสะแกกรังมีปริมาณมากประกอบกับมีฝนตกมากบริเวณจังหวัดนครสวรรค์และชัยนาท จึงส่งผลทำให้ปริมาณน้ำไหลผ่านที่เขื่อนเจ้าพระยาสูงกว่าที่ค่ายจิรประวัติ

จากกราฟแสดงข้อมูลปริมาณน้ำไหลผ่านสะสมรายเดือนพบว่าเดือนสิงหาคมปริมาณน้ำในลุ่มเจ้าพระยาตอนบนเพิ่มขึ้นจากเดือนกรกฎาคมเกือบเท่าตัว และในเดือนกันยายนปริมาณน้ำลดลงเล็กน้อย ส่วนที่สถานีค่ายจิรประวัติปริมาณน้ำช่วงเดือนสิงหาคมเพิ่มสูงขึ้นจากเดือนกรกฎาคมค่อนข้างมากและในเดือนกันยายนระดับน้ำยังคงเพิ่มสูงขึ้นอีกมาก เช่นเดียวกันกับสถานีท้ายเขื่อนเจ้าพระยาที่ปริมาณน้ำเพิ่มขึ้นอย่างต่อเนื่อง ซึ่งอาจเป็นผลมาจากปริมาณน้ำที่ไหลเข้ามาสมทบเพิ่มเติมและจากปริมาณฝนที่ตกในพื้นที่ แต่เมื่อดูภาพรวมทั้งเดือนจะพบว่าปริมาณน้ำที่เขื่อนเจ้าพระยาน้อยกว่าที่ค่ายจิรประวัติเล็กน้อย เนื่องมาจากช่วงที่ปริมาณน้ำที่เขื่อนเจ้าพระยามากกว่าที่ค่ายจิรประวัติ เกิดขึ้นเพียงในช่วงวันที่ 14-27 กันยายนเท่านั้น